Tout au long du jeu, les joueurs pourront utiliser leurs samouraïs, shugenja (prêtres utilisant la magie), courtisans, ninja, moines...

Quatre clans sont en guerre : les Lion, orientés très militaires,les Phoenix, faisant de l'honneur leur maitre à penser, les Scorpion adeptes de faire déshonorer les clans adverses et les Dragon, qui ne rêvent que de Lumière.

Lorsque vous utilisez des cartes supplémentaires de L5R, vous pouvez jouer l'un des clans en guerre de l'honneur, même ceux non inclus, comme le crabe, Grue, Mante...

Vous pouvez personnaliser votre deck de telle sorte que le clan Lion se concentre sur l'honneur, le Scorpion sur l'illumination, ou ce que vous voulez !

Toute carte de L5R est utilisable !